Медицинское обслуживание в Школе обеспечивается Государственным бюджетным учреждением здравоохранения Сахалинской области «Южно – Курильская центральная районная больница» по договору между Школой и учреждением здравоохранения медицинскими работниками, которые наряду с администрацией и педагогическими работниками несут ответственность за проведение лечебно-профилактических мероприятий, соблюдения санитарно-гигиенических норм, режима и качества питания обучающихся.

В связи с тем, что Школа расположена на расстоянии 55 км от ГБУЗ Сахалинской области «Южно — Курильская ЦРБ», квалифицированную и оперативную медицинскую помощь работники и обучающиеся Школы получают в ФАП села Дубовое и ФАП села Головнино.